醫院科室的合同是否有效，要看合同當事人是否具有民事行為能力，意思表示是否真實，違反了法律、行政法規的強制性規定，不違反公序良俗。第壹百四十三條符合下列條件的民事法律行為有效: (壹)行為人具有相應的民事行為能力；(2)意思表示真實；(三)不違反法律、行政法規的強制性規定，不違背公序良俗。
法律依據
中華人民共和國民法典
第壹百四十三條符合下列條件的民事法律行為有效:
(壹)行為人具有相應的民事行為能力；
(2)意思表示真實；
(三)不違反法律、行政法規的強制性規定，不違背公序良俗。
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