1.註冊是對執業藥師資格的確認和許可，是執業藥師開展執業活動的前提條件。執業藥師只有辦理註冊手續，取得《執業藥師註冊證》，才有資格從事藥學咨詢、藥品處方點評、藥品銷售和藥學服務工作。而備案只是行政管理的壹種手段。
2.根據《中華人民共和國中醫藥法》和《醫療機構管理條例》的規定，中醫診所必須依法取得《醫療機構執業許可證》，並按照許可證核定的診療科目開展診療活動。中醫診所需要有註冊滿3年的執業醫師，或者中醫醫師。備案用於記錄和管理執業藥師的執業活動，不涉及執業藥師的執業資格和執業範圍。