法律分析:某公司員工申請勞動仲裁只是解決勞動爭議的壹種法律途徑。被適用和適用的是法律權利和程序義務。被應聘不會影響公司的信譽，也不代表公司有違法不良行為，不會被列入黑名單或處理。最多是因為勞資糾紛太多，上級部門提示公司加強管理和公司的約束機制建設，構建和諧的勞資關系。
法律依據:《中華人民共和國勞動爭議調解仲裁法》第五條。發生勞動爭議，當事人不願協商、協商不成或者達成和解協議後不履行的，可以向調解組織申請調解；不願調解、調解不成或者達成調解協議後不履行的，可以向勞動爭議仲裁委員會申請仲裁；對仲裁裁決不服的，除本法另有規定外，可以向人民法院提起訴訟。
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