公務員在營利性組織兼職報酬的處理辦法根據具體情況確定。通常，他們會被記過或記大過。情節嚴重的，給予降級或者撤職處分。情節嚴重的，給予開除處分。違反規定兼職並領取報酬，明顯違反規定從事或者參與營利性活動，或者違反規定兼職並領取報酬的，給予警告、記過或者記大過處分；情節嚴重的，給予降級或者撤職處分；情節嚴重的，開除。如果勞動合同法不要求簽訂書面勞動合同，雙方自願簽訂合同，但如果能簽訂書面合同最好。
法律依據
《行政機關公務員處分條例》第二十七條從事或者參與營利性活動，在企業或者其他營利性組織中兼任職務的，給予記過或者記大過處分，給予降級或者撤職處分，給予開除處分。