正在重建的房屋和商品房有兩個主要區別:
1.收購方式:商品房以貨幣交易的形式收購，回建的房屋主要以補償的形式收購。
2.土地性質:正在重建的房屋大多是用政府劃撥的土地建設的，土地性質為劃撥土地，而商品房全部出售。
3.交易稅費:在交易過程中，對於已經劃撥土地的房屋，需要向當地稅務部門繳納壹定的土地出讓金，而商品房沒有這項費用。