1，性質不同:起訴意見書是公安機關將已經偵查終結的刑事案件移送人民檢察院起訴時作出的法律文書；刑事案件偵破報告是公安機關向人民檢察院提請起訴或者免予起訴的案件的報告。
2.內容不同:起訴意見書的主要內容包括犯罪嫌疑人的基本情況、案件來源、偵破過程、涉嫌的犯罪事實等四個部分。刑事案件破案報告包括案件來源、案件經過、犯罪嫌疑人基本情況、抓捕過程、破案過程、時間、地點、方法、繳獲物品等內容。