企業可以根據業務的實際情況進行確認。比如企業提前采購了商品，但是企業實際已經收到了商品，但是沒有收到對方的發票，這種方式會先記錄預計庫存商品，沖減預付賬款，然後再和對方溝通。如果最後確實收不到發票，最後結算的時候會增加。
如果公司長期支付的預付賬款符合下列稅法規定的條件，經稅務機關批準後，可作為損失列支，計入營業外支出核算。如果損失被核銷，可以作為債權轉入其他應收款。
根據《財政部國家稅務總局關於企業資產損失稅前扣除政策的通知》(財稅[2009]57號)，企業除貸款債權以外的應收賬款和預付賬款符合下列條件之壹的，在扣除可收回金額後確認的無法收回的應收賬款和預付賬款，可以在計算應納稅所得額時作為壞賬損失扣除:
債務人被依法宣告破產、關閉、解散或者被撤銷，或者被依法註銷、吊銷營業執照，其清算財產不足清償的。債務人死亡，或者被依法宣告失蹤、死亡，其財產或者遺產不足清償的。債務人超過3年未清償債務，並有確鑿證據證明其已無力清償債務。與債務人達成債務重組協議或者法院批準破產重組方案後，無法收回。