為激發研究生教育活力，提高研究生培養質量，福州大學持續推進研究生培養機制改革，完善研究生培養激勵機制，健全擇優、獎優、助學相結合的獎勵扶助制度，具體如下:
1，撥款。國家助學金，覆蓋所有全日制研究生，每生每年6000元；博士助學金，覆蓋所有全日制非定向博士生，每生每年2.7萬元。
2.優秀的學術獎學金。全日制碩士優秀學術獎學金設特等獎、壹等獎、二等獎、三等獎，獎金分別為12000元、8000元、5000元、3000元，全程評定兩次，即中期和綜合優秀學術獎學金。
3.研究生國家獎學金。用於獎勵學業成績突出、科研成果顯著、在社會公益活動中表現突出的研究生。
4.增加研究生助教、科研助理、管理助理的補貼。學校將按規定統籌使用科研經費、學費收入、社會捐贈等資金，設立研究生“三助”崗位，提供“三助”補助。
5.學校還設立了“研究生優秀學位論文獎”等獎項，鼓勵和支持研究生努力學習，潛心科研，出高水平成果。