母子不在同壹戶口本，不影響母子法律關系的成立。從法律上講，只要是事實上的母子關系，即使不在同壹個戶口本，不在同壹個地方居住，也是有母子關系的。從戶籍上不能確認為母子關系的，應當有相應的證據或者證明予以確認。
我國婚姻法對父母子女關系作了如下規定:
(1)父母對子女有撫養教育的義務，子女有要求父母支付贍養費的權利。
(2)父母有保護和教育未成年子女的權利和義務。
(3)子女有贍養父母的義務，父母有要求子女支付贍養費的權利。
(4)父母與子女有相互繼承的權利。父母和子女都是繼承法規定的第壹順序繼承人。
(5)子女應尊重父母的婚姻權利。父母有離婚和再婚的權利和自由，子女不得幹涉父母再婚和結婚的自由。
(6)父母有探望子女的權利。離婚後，不直接撫養子女的壹方有探望子女的權利，另壹方有幫助的義務。
因此，父母子女關系是合法的，即受我國婚姻法的規範，不會因為戶籍分離而解除。