14年的創業生涯，讓張本正越活越年輕。他親手培養的清華紫光和他的關系，壹直都是微妙的，密不可分的，就像他和母校清華大學的關系壹樣。在很多人指責他們太習慣校辦企業的同時，紫光已經成長為中國重要的高科技企業之壹，令人印象深刻。
但是，英雄也有悲傷。在經歷了2001的年度金融危機後，張本正又遭遇“七月大火”，紫光股份面臨上市後最大危機。壹時間，紫光四面楚歌，重重摔在了科技神壇上。
2002年，馬年。張本正的辦公室是“萬馬奔騰”，墻上掛著徐悲鴻的《八馬全圖》，桌上擺著精美的銅馬...看來這位從小就有使命感的總統顯然是想為高科技神壇盡綿薄之力。分成筆記本的張本，就像他的名字壹樣，從來沒有想過自己會創業。他可以去種田，可以去教學，可以去科研，但是他從來沒有想過他會去做生意。他被推進了海裏。
1988年的壹個夏天，當時還是科研部副主任的張本正被清華大學校長張小雯找去談話。校長想讓他去學校辦的公司。個子不高的張本正不願意去。他認為電視上的商人不願意去是因為他們在大吃大喝。校長說:“妳張本正比我年輕。妳怎麽會比我保守？”？這是高科技，新行業，給妳24小時考慮。“第二天，校長問張本正是怎麽考慮的。張本正說他已經想好了。第壹句是“我服從分配”，第二句是“我還是不想去”。校長說:“第壹句我聽了，第二句妳自己消化。"
就這樣，滿臉不情願的張本正，不得不放下學者的架子和清高，帶領紫光(當時叫清華大學科技發展總公司)在當時被視為“吃飽了喝足了奸商，無所事事”的商海中搏殺。
從學者到商人，從教授到校長的轉變，是張本正始料未及的。但是讓他在學習和經商之間選擇，他還是會選擇後者，他願意被拖進大海。被推進海裏的張本正應該說是幸運的。清華大學在背後為他提供技術支持，他不用賣掉房子和家當來籌集啟動資金，但這無形中給了他更大的壓力。如果只是壹個名不見經傳的公司，妳可以用幾萬元的啟動資金悄悄把蛋糕做大，然後壹夜成名，所有的成績接踵而至；即使失敗了，也是很自然的，不會受到太多的批評。但對於紫光來說，從壹開始就被賦予了太多的期待，所以只能成功，不能失敗。
公司運營之初，如何定位就成了難題。1984，中國科學院技術研究所技術開發公司(聯想前身)成立。兩年後，北大新技術公司(北大方正前身)正式落戶中關村。就在1988年中期，中央辦公廳提出了設立中關村高新技術實驗區的建議。本著這壹精神，清華大學科技發展公司於當年7月宣告成立。
最開始的時候，紫光有點像百貨公司。張本正等人只能壹邊定位壹邊做，靠自然生長法，到處撒種，卻希望東方不發光，西方發光。張本正以1.5萬元的啟動資金，壹下子啟動了30多個部門，規定“年末人均利潤未達到1.5萬元的部門關停並轉，第二年人均利潤下限提高到2萬元。”就這樣，優勝劣汰做了五年，到1993，公司的營業額居然超過了100萬，利潤也超過了100萬。能有這個結果是因為當時市場競爭不是很激烈，資源有限，清華有特殊的人才優勢，然後拿100多萬像胡椒面壹樣撒，這絕對是找死。
紫光的定位從1993成立紫光(集團)總公司開始明確。張本正作為總裁，根據市場需求對業務進行了大整合，他的品牌定位也是在這個時期確立的。調整後的紫光集中於信息電子、生物制藥、環保產業三大板塊。信息電子集R&D、生產和銷售於壹體，主要包括掃描儀、筆記本和系統集成。
認識到入世後生物技術和信息技術並肩作戰，有更好的發展前景，紫光瞄準生物制藥，收購紫光成為紫光21事業部、9個子公司、3家合資公司的壹員。“人才加資本”的模式成為紫光拓展市場的重要壹步。紫光1.5萬的啟動資金，乍壹看不是小數目，但對於高科技企業來說就是杯水車薪，更別說壹下子支持30多個部門了。所以在資金和運營上，紫光面臨著所有企業早期的“兒童綜合癥”和營養不良。
對商業壹竅不通的張本正，不得不離開科研部門四處遊說的平靜生活，放下學者的清高和以前對金錢的不屑，開始考慮如何借錢，如何賺錢，如何與人搞好關系，如何扛起紫光這個極其沈重的大旗。有壹次，張本正去了壹家不知名的銀行，和別人遊說了幾個小時。憑著壹張金口玉言和清華的金字招牌，他居然貸款1萬元，晚上高高興興跑回來，壹夜睡不著。
張本正因為不懂法律知識，按照計劃經濟走向市場經濟，被騙了好幾次。幾場官司下來，紫光輸得很慘，要麽是不知道如何取證，要麽是太相信自己的“理”。後來張本正請了兩個常年法律顧問，把所有能管他的部門都搞清楚了，找銀行，找政府，找企業，找關系，終於找到了壹條經營企業的路子——首先讓別人了解妳。
張本正的知名度就是從那個時候培養起來的。張本正不否認自己的成熟是壹次又壹次的錯誤積累起來的。他認為自己最大的錯誤是北京延慶制藥廠的投資規模太大。後來我才知道，我們可以用更有效的方式進入壹個領域，比如收購、控股。這壹行不犯錯是不可能的，很多公司都因為CEO犯了重大錯誤而致人死亡。紫光不是沒有錯誤，而是沒有致命的錯誤。就像人生病壹樣，大病是致命的，小病卻能增強免疫力。如果刻意避免錯誤，壹個企業就會失去發展的動力。1988紫光剛成立不久就開始做臺灣壹家掃描儀公司的中國大陸總代理。當紫光把別人的品牌打造成中國掃描儀市場第壹品牌的時候，臺商把紫光壹腳踢開，自己開始直銷。張本正當時不想哭是假的。渾渾噩噩做了八年，連代理合同都沒簽，人去樓空，告訴他怎麽去見江東的長輩。
看到紫光在中國打開掃描儀市場後，臺商紛紛模仿紫光，紫光辦展的地方，臺商就辦展。紫光在哪裏設代理，就在哪裏也設代理。後來紫光開始反擊，和臺商的競爭對手建立了代理關系。目的是刺激他，希望他能回心轉意，試探他是否敢除掉紫光。沒想到，臺商並不在意。太自戀，又囿於原地，壹直安於做經紀人的張本正，壹時半會兒也不折了。他才學會競爭，才明白競爭不是吃大鍋飯，其實是吃自助餐。這道菜不好吃，還有別的。妳不做，別人也會做。如果妳筋疲力盡，會有更多的人嘗試去做。
1996年4月，被甩的張本決心做壹個自己品牌的掃描儀。但問題又來了:用戶接受的掃描儀壹直是海外生產的。不買國貨怎麽辦？張本正認為這對紫光來說是壹個非常重要的戰略轉折點，他認為這樣會冒很大的風險。但回過頭來看紫光的表現，張本正的決定是正確的，也要感謝臺商。是他們的無情讓紫光絕望。紫光掃描儀上市僅30天就成功了。成為當年市場第三品牌，1999成為中國第壹個國有品牌掃描儀。
吃壹塹，長壹智。紫光再做筆記本電腦的時候，壹開始就推出了自己的品牌。雖然在創業之初，張本正對企業的定位還很茫然，壹步壹個腳印地往前走，但他很早就意識到股市融資的重要性，早在1995就提出紫光要上市。
張本正去教委跑指標，教委批準了，證監會也批準了。所有的文件都有了，配額也有了。但由於學校的壹些考慮，清華同方在6月上市1996 11。張本正認為，1996年紫光上市失敗是紫光發展的巨大損失，失去了很多機會。但從學校的角度來看，它可能會翻開清華工業的新篇章。
紫光沒有氣餒。兩年後，紫光終於在深交所掛牌上市。新股以網上推介的形式發行，在中國證券業尚屬首次，引起了股民的極大興趣。每股發行價11.75元，市盈率22.22倍，創歷史新高。