如果我們理解“SAP系統指的是ERP”這個概念，那麽SAP系統和MES系統的關系就如同ERP和MES系統的關系壹樣。壹般來說，企業信息系統分為三個層次。
最上層是管理層，對應的系統是ERP。中間層是執行層，對應的系統是MES。最底層是控制層或設備層，對應SCADA、DCS或PLC。至於如何整合SAPERP和MES，SAP本身提供了很多中間件套件來整合。
即使MES沒有標準接口，也可以按照SAP中間件套件的標準開發相應的接口。大多數系統的集成有幾種方式:壹種是中間數據庫的方式，通過中間數據庫實現數據的集成和交互；另壹種方法是直接讀寫數據消息或數據文件。
另壹種方法是SOA，它是基於服務的集成。最後壹種更常見，技術上更成熟，也更安全。
擴展數據:
SAP和MES都是ERP軟件。前者的幾個模塊主要服務於生產、物料、銷售、成本、財務，公司使用的模塊側重點壹般不壹樣。
後者主要用於物流倉儲。從原材料或配件進廠采購到內部物流的轉移、計劃和調度，每個公司也有不同的側重點。
兩者都是基於上線時需要開發壹些功能。SAP和MES可以在系統中相互通信。但是這個系統啟動起來比較麻煩，通常需要項目組對核心用戶進行培訓。
在SAP中，MES被稱為“knowperfectfactory”，關鍵是要有壹個大屏幕來監控生產過程。MES不僅是生產計劃的管理，包括生產計劃、生產過程、生產人員的回歸力，還可以優化企業的生產管理，建設智能工廠。SAP是壹個ERP軟件(企業資源規劃軟件)。