民辦非企業單位登記證書過期，可以進行換證。對連續兩年不參加年檢，或連續兩年“年檢不合格”的民辦非企業單位，予以撤銷登記並公告。
未在規定時限內接受監督檢查，違反了《社會團體登記管理條例》第三十壹條第壹款、《民辦非企業單位登記管理暫行條例》第二十三條：社會團體、民辦非企業單位應當於每年3月31日前向業務主管單位報送上壹年度的工作報告，經業務主管單位初審同意後，於5月31日前報登記管理機關，接受年度檢查。”的規定，根據《社會團體登記管理條例》第三十三條、《民辦非企業單位登記管理暫行條例》第二十五條：“社會團體、民辦非企業單位有下例情形之壹的，由登記管理機關給予警告、責令改正，可以限期停止活動，並可以責令撤換直接負責的主管人員；情節嚴重的，可以予以撤銷登記：（三）拒不接受或者不按照規定接受監督檢查的。”的規定，會向未按規定時限接受年檢的社會團體、民辦非企業單位發送限期整改通知書，接到本限期整改通知書 7日內辦理年度檢查，逾期不接受監督檢查的，登記管理機關將依法作出限期停止活動、責令撤換直接負責的主管人員，直至撤銷登記的行政處罰。
民辦非企業；組織性質；社會組織。
民辦非企業單位，是指企業事業單位、社會團體和其他社會力量以及公民個人，利用非國有資產舉辦的從事非營利性社會服務活動的社會組織。如各類民辦學校、醫院、文藝團體、科研院所、體育場館、職業培訓中心、福利院、人才交流中心等。
《民辦非企業單位登記管理暫行條例》
第二十三條 民辦非企業單位應當於每年3月31日前向業務主管單位報送上壹年度的工作報告，經業務主管單位初審同意後，於5月31日前報送登記管理機關，接受年度檢查。工作報告內容包括:本民辦非企業單位遵守法律法規和國家政策的情況、依照本條例履行登記手續的情況、按照章程開展活動的情況、人員和機構變動的情況以及財務管理的情況。
《民辦非企業單位年度檢查辦法》
第二條 民辦非企業單位年度檢查（以下簡稱年檢），是指登記管理機關對民辦非企業單位，依法按年度進行檢查和監督管理的制度。
第三條 經登記管理機關核準登記的民辦非企業單位，應當按照本辦法的規定，接受登記管理機關的年檢。
截至上年度12月31日，成立登記時間未超過6個月的民辦非企業單位，不參加當年的年檢。
第四條 民辦非企業單位年檢的程序是：
（壹）民辦非企業單位領取或從互聯網下載《民辦非企業單位年檢報告書》及其他有關材料；
（二）民辦非企業單位於每年3月31日前向業務主管單位報送年檢材料，經業務主管單位出具初審意見後，於5月31日前報送登記管理機關；
（三）登記管理機關審查年檢材料；
（四）登記管理機關作出年檢結論，發布年檢結論公告。
第五條 民辦非企業單位接受年檢時，應當提交下列材料：
（壹）已填具的《民辦非企業單位年檢報告書》；
（二）《民辦非企業單位登記證書》副本；
（三）財務會計報告；
（四）其他需要提交的有關材料。
已經取得執業許可證的民辦非企業單位，應當提交執業許可證副本。
登記管理機關在年檢期間，可以根據情況，要求民辦非企業單位提交註冊會計師審計報告、其他補充說明材料及有關文件。登記管理機關可以要求有關人員說明情況，必要時進行實地檢查。
第六條 年檢的主要內容包括：
（壹）遵守法律法規和國家政策情況；
（二）登記事項變動及履行登記手續情況；
（三）按照章程開展活動情況；
（四）財務狀況、資金來源和使用情況；
（五）機構變動和人員聘用情況；
（六）其他需要檢查的情況。
第七條 民辦非企業單位年檢結論，分為“年檢合格”、“年檢基本合格”和“年檢不合格”三種。
年檢結束，登記管理機關應當在《民辦非企業單位登記證書》（副本）上加蓋年檢結論戳記。民辦非企業單位更換登記證書，應當保留原有年檢記錄。
第八條 民辦非企業單位有下列情形之壹，由登記管理機關責令改正，情節輕微的，確定為“年檢基本合格”；情節嚴重的，確定為“年檢不合格”：
（壹）違反國家法律、法規和有關政策規定的；
（二）違反規定使用登記證書、印章或者財務憑證的；
（三）本年度未開展業務活動，或者不按照章程的規定進行活動的；
（四）無固定住所或必要的活動場所的；
（五）內部管理混亂，不能正常開展活動的；
（六）拒不接受或者不按照規定接受登記管理機關監督檢查或年檢的；
（七）不按照規定辦理變更登記，修改章程未按規定核準備案的；
（八）設立分支機構的；
（九）財務制度不健全，資金來源和使用違反有關規定的；
（十）現有凈資產低於國家有關行業主管部門規定的最低標準的；
（十壹）侵占、私分、挪用民辦非企業單位的資產或者所接受的捐贈、資助的；
（十二）違反國家有關規定收取費用、籌集資金或者接受使用捐贈、資助的；
（十三）年檢中隱瞞真實情況，弄虛作假的。
第九條 “年檢基本合格”和“年檢不合格”的民辦非企業單位，應當進行整改，整改期限為3個月。整改期結束，民辦非企業單位應當向登記管理機關報送整改報告，登記管理機關對整改結果進行評定並出具意見。
對“年檢不合格”的民辦非企業單位，登記管理機關根據情況，可以責令其在整改期間停止活動。民辦非企業單位被限期停止活動的，登記管理機關可以封存其登記證書、印章和財務憑證。
第十條 登記管理機關對連續兩年不參加年檢，或連續兩年“年檢不合格”的民辦非企業單位，予以撤銷登記並公告。