壹、保稅加工工廠可以大致分為兩種：（壹）是利用零部件和成品和關稅差異賺取利潤（大體上說，越high level的東西進口鋁越低）簡單說有兩種，或是從國外進口零件，在國內加工成品，若沒有保護區，需要交零件的關稅，稅率高，若是在保護區內加工為成品，（可以簡單加工，也可以實質加工，不同保稅區有不同的規定，監管條件也不同，加工越深，監管越嚴）再進口，就可以節約部分關稅（成品率更低），當然也可以直接出口到國外。（ 二）是賺取出口退稅的利潤（壹日遊），國內A企業的某個出口至保稅區，相當於出口，享受退稅（增值稅9%- 17%），然後B 企業（必須是加貿型企業），以加工貿易的方式進口（免稅），裝配為成品後再出口，A 企業賺取了出口退稅的利潤，B 企業用到了國內低廉價格的配件（名義上國外進口），又節約了物流成本。
二、其流行原因是因為優勢很多：“保稅”，進入保稅區的貨物不需要交納進出境關稅和增值稅，屬於“境內關外”，國外貨物入區保稅，國內貨物入區視同出口，實行退稅。對於設立在保稅區的工廠，可以享受以下政策（好處）：（1）保稅倉儲（2 ）深加工結轉；（3）大部分保稅區減免企業所得稅，交易保稅貨物免征增值稅，消費稅，還給企業各種優惠政策；（4） 免稅免征，可以避免進口貨物到港時不能及時清關時產生的巨額滯港費；