從本質上講，物流信息系統是連接各種物流活動的通道，是壹個集成的過程。整合過程應基於四個功能級別:交易、管理控制、決策分析和戰略規劃系統。
第壹層是交易系統，包括記錄訂貨內容、安排庫存任務、選擇作業流程、裝貨、運輸、配送、發貨、開發票、客戶查詢等。交易系統的特點是格式規則、互動交流、批量交易、程序化操作。結構化流程和大規模交易的結合，主要強調信息系統的效率。物流信息管理系統的管理控制、決策分析和戰略規劃的加強需要建立在強大的交易系統基礎上。
第二個層次是管理控制，需要關註功能度量和報告。功能測量對於提供關於服務水平和資源利用的管理反饋是必要的。因此，管理控制包括評估過去的職能和確定各種備選方案。當物流信息系統需要報告物流系統過去的功能時，物流信息系統是否能夠識別其處理過程中的異常情況也很重要。
第三個層次是決策分析，側重於決策的應用，幫助管理者識別、評估和比較物流戰略和戰略備選方案。決策分析與管理控制的區別在於，決策分析的主要重點是評估未來戰略的備選方案，它需要相對的靈活性，以便做出廣泛的選擇。因此，用戶需要有更專業的知識和訓練來使用它的能力。由於決策分析的應用少於交易，物流信息系統的決策分析更傾向於強調有效性而不是效率。
最後壹個層次是制定戰略計劃，重點是信息支持，以便制定和完善物流戰略。這種決策往往是決策分析層面的延伸，但通常更抽象松散，更著眼於長遠。
(二)物流信息系統的組成
物流信息系統本身也是壹個系統，具有系統的壹般特征。信息系統是企業或組織的內部神經系統，具有全局性作用；目的性表現在，信息系統的最終目的是為管理決策提供信息支持；信息系統可以分解，整個組織的信息系統可以分解成幾個子系統，每個子系統又可以劃分成幾個模塊...顯示系統的層次結構；系統各組成部分之間有各種聯系，這反映了它們的相關性；因為信息系統最終是為管理和決策服務的，而管理和決策依賴於企業或組織各方面的變化和外部環境的變化，環境的變化必然導致信息系統的變化。因此，壹個好的信息系統應該具有良好的環境適應性。
在物流信息系統的設計中，可以利用“自頂向下”的原理，將系統分解成若幹個子系統，然後對這些子系統進行逐級分解和優化，使其結構清晰、功能明確、易於實現。簡單來說，物流信息系統壹般由以下子系統組成，每個子系統都有自己獨特的功能:
管理子系統:提供與具體業務無關，但系統需要的功能；
采購子系統:提供原材料采購信息的功能；
倉庫管理系統:使用倉庫管理系統管理倉儲業務的接收、發送、分揀、放置、補充和分配。
發送等。，同時倉庫管理系統可以進行庫存分析和財務系統集成；
庫存子系統:提供庫存管理信息的功能；
生產子系統:提供生產產品信息的功能；
銷售子系統:提供產品銷售信息的功能；
配送子系統:指根據貨物的配送類型分類後，根據貨物的重量、體積等各種因素擬定的調度計劃、容積裝載計劃、配送行程計劃等操作系統；
運輸子系統:提供產品運輸信息的功能；
財務子系統:提供財務管理信息的功能；
決策支持子系統:使物流信息系統更上壹層樓。
以上只是物流信息系統功能的框架劃分，並沒有明確重要子系統之間的關系。例如，庫存子系統與采購子系統和生產子系統密切相關，等等。在物流信息系統的結構中，應確定子系統間的信息流和數據接口(包括通信協議和數據標準的定義)，以滿足子系統間數據交換的通信要求。
對於企業來說，在實施物流信息系統時，要根據自身的行業特點和自身的物流業務流程，規劃和設計獨特的物流信息系統架構。在架構設計中，應遵循以下原則:
1.它具有開放性、模塊化和適應性的特點。
2.滿足系統間的數據交換，數據交換的方法必須保證數據的完整性和安全性。
性；
3.數據交換只需要通用的數據定義、信息格式和通信協議。這樣可以保證不同部門開發的獨立系統的互操作性；
4.它與現有系統和更新的通信技術兼容；
5.盡可能與現有技術和已開發的系統兼容；
6.在物流信息技術方面，讓企業在競爭激烈的市場中有廣泛的選擇。
企業物流管理信息的系統化主要體現在以下幾點:
1.庫存管理:如果在倉庫的貨物包裝、拆解、調撥過程中實施物流管理信息系統，可以準確掌握庫存數量、出庫數量、入庫數量、入庫結存數量等數據，實現物流訂單信息的預測管理。
2.管理運輸過程。在企業運輸過程中，可以在運輸過程中的接單管理、發貨管理、到貨管理、收貨管理、單據管理等四個環節實施物流信息化管理，如路單管理、報關管理、聯運提單管理、海運提單管理等，大大提高服務效率，同時可以及時解決企業貨物配載、車輛調度、車輛返空等問題。
3.監控整個物流過程。業務流程集中管理、各環節收費管理、各環節責任管理、各環節結算管理、各環節成本管理、運輸管理、倉儲管理、統計報表系統等。，這些物流過程數據的獲取有利於對各個環節進行具體的統計和分析，從而系統地指導當前的企業運營，便於科學的統籌規劃和合理的安排部署。
4.監控物流成本。在物流業務管理中，經常會產生壹系列與成本相關的數據，這些數據可以與專業財務系統的數據進行對接，有利於對物流成本進行全過程監控，達到降低費用、節約開支的目的。
5.實現客戶和物流企業的信息共享。貨物的物流配送，貨物的中轉運輸-貨物的實時跟蹤，貨物的庫存，貨物的平衡，貨物的損壞，貨物的接收等。，往往是客戶最關心的內容。如果實行物流信息化管理，將方便客戶隨時查詢，從而提高物流服務質量，增強其在客戶心中的信譽度。