中國煙草部門是國家垂直管理系統，不歸地方各級部門管理，只歸國家煙草專賣局管理。在中央層面，煙草專賣局由工信部管理。
國家煙草專賣局，簡稱國家煙草局，成立於1984。它是由工業和信息化部管理的國家局，與中國煙草總公司合署辦公。對中國煙草行業實行統壹領導、垂直管理和專賣管理體制，對全行業“人、財、物、產、供、銷、內、外、貿”進行集中統壹管理。
國家煙草專賣局的主要職責如下:
1.制定煙草行業發展戰略、規劃和政策，調整產業結構，促進行業合理布局。
2、依法實施煙草專賣管理，查處違法案件，依法取締和關閉計劃外煙廠，保護合法經營。
3.組織實施國家財務會計制度，依法對所屬企業國有資產行使出資人權利，經營管理國有資產，承擔保值增值責任，管理和監督煙草行業財政資金，組織實施煙草行業內部審計。
4.組織煙草行業的生產、經營和對外經濟技術合作，編制並組織實施煙草專賣品產供銷和進出口年度計劃，編制煙草行業固定資產投資計劃，審批煙草制品生產企業固定資產投資項目，指導行業安全生產，依法處理重大安全事故。
5、提出煙草行業有關經濟政策建議，制定煙草專賣品價格政策，管理煙草專賣品價格。
6、負責組織實施煙草行業體制改革，指導煙草企業改革，推進卷煙行業企業聯合重組，培育具有國際競爭力的大企業，依法審批煙草企業的設立、分立、合並和註銷。
中華人民共和國煙草專賣法第四條國務院煙草專賣行政主管部門主管全國煙草專賣工作。省、自治區、直轄市煙草專賣行政主管部門主管本轄區內的煙草專賣工作，受國務院煙草專賣行政主管部門和省、自治區、直轄市人民政府雙重領導，以國務院煙草專賣行政主管部門領導為主。