壹、企業對信息化的認識不夠。
部分中小企業覺得“信息化是高科技的技術，對於中小企業來說太過奢侈”，而也會有企業覺得“信息化的代價過於高昂，對企業來說是壹個沈重的負擔。”甚至有壹大部分中小企業覺得“不用信息化系統，企業照樣能搞好”。
二、軟件選型是難題
對於軟件選型，企業需要在前期向專業的信息化人員咨詢，明確自身企業的信息化需求，從產品的品牌、規模、專業性、服務能力、已有客戶、價格等多方面比對，選擇適合自己企業的產品。
三、信息化系統實施充滿艱辛
信息化系統的實施是壹項周期長、風險大、涉及面廣的系統工程，實施過程中要投入大量的人力、物力和財力。壹般的信息化系統項目開發周期至少要半年，長的可達二到三年；信息化投入巨大體現在，需要有連續的投入，系統運行後還需要壹筆維護費用。而實施過程復雜、涉及面廣主要是因為信息系統的建設需要對資源進行整合，涉及到大量的內部數據處理。因此，沒有壹個相對較高的戰略視角，信息化建設就無法應對未來的變數。
四、領導對信息化不重視
信息化系統是個需要實施、需要維護的系統，壹旦缺少管理，反而會對企業產生制約，影響企業辦公效率。這就導致了企業對信息化投入了大量的前期資金，但是並沒有見到效益的提升，因此企業決策者就更加不重視，這就形成了壹個惡性循環。
五、信息化人員匱乏
信息化技術人才遠遠不能滿足企業的需求。