應抵退稅（費）明細中多繳發生日期前欄次均需錄入（包括未打*號的欄次），退稅類型不可選減免退稅（因減免類型、減免大類等項目無法輸入）、先征後退；多繳發生日期務必選擇當前操作日期，否則會導致後臺核算錯誤。
退稅操作流程：
對入庫時間為2015年1-8月的入庫稅款辦理退稅
1、錄入退抵稅費信息
涉稅受理崗在管理服務—文書管理—退稅類—錄入退抵稅費信息（如在功能菜單中找不到該項目，可以在搜索欄中輸入退抵稅費後查詢，支持拼音輸入模糊查詢）
錄入退抵稅費信息中輸入納稅人識別號，如查無此戶，說明該納稅人很可能是零散稅收納稅人，此時輸入識別號999，回車（系統響應時間較長，請耐心等待，MIS系統中1-8月的零散稅收因登記資料未進行遷移，所有征收單位均將原零散稅收入庫數據統壹用999這個組織臨時登記識別號進行歸納）。
雖然遷移至金三系統的零散稅收均無納稅人具體名稱及原始的MIS系統管理編碼，但可以通過入庫時間、稅票字軌、稅票號、稅種、行業、登記註冊類型及匯總繳款書等信息進行比對確定原始入庫信息。
例如說電子稅票號為554922499的記錄，其票證號碼為01200082，入庫日期為1月6日，票證種類為稅務收現，字軌為（131），匯總繳款書票號為00836354。
通過以上查詢可以相對方便的查詢出2015年1-8月遷移至金三系統的零散稅收入庫數據。
零散稅收如存在欠稅則無法發起錄入退抵稅費信息流程，需要通過涉稅受理崗在申報征收—申報征收遷移數據補償—沖減應繳稅費（上線前）模塊對該部分稅款進行沖減。（如在功能菜單中找不到該項目，可以在搜索欄中輸入沖減應繳稅費（上線前）後查詢，支持拼音輸入模糊查詢）
沖減完畢後重新錄入應退抵稅費
在無欠稅情況下可以通過錄入識別號999後回車查詢即可
註意事項：因999部門臨時登記納稅人歸集的零散稅收戶數較多，在退抵稅（費）明細查詢中最好錄入具體的票證字軌、票證號碼，否則會提示系統錯誤（因為系統會報錯提示查詢結果超過1000條）
因999識別號均無銀行賬號等必要信息，因此只能在身份證欄次輸入身份證件號(此時輸入辦理退稅的人員的身份證號碼)
註意事項：
A、提退稅金類型可選減免退稅（費）、匯算清繳（結算清繳）退稅（費）、誤收退稅（費）。其他退稅（費）壹般情況下沒有，謹慎選擇；先征後退為國稅業務。
B、提退稅金類型為匯算清繳（結算清繳），退抵稅費原因類型中如所退稅種為企業所得稅，選擇匯算清繳退稅，所退稅種為土地增值稅，選擇清繳退庫；
提退稅金類型為誤收退稅（費），退抵稅費原因類型不能選車輛購置稅因異地重復繳納退稅；
提退稅金類型為誤收退稅（費），退抵稅費原因類型不能選葡萄酒消費稅退稅。其他原因退稅謹慎選擇
C、退稅方式選1、退稅
D、走完該流程選擇保存、推送到有關崗位進行審核後由稅收會計在開具收入退還書中打印（此處應用白紙打印收入退換書，然後系統外按收入退還書格式套打，因為999識別號對應的納稅人名稱均為XX稅務局（組織臨時登記）而非辦理退稅的具體納稅人名稱，也缺乏對應的納稅人開戶行名稱及賬號信息，因此需要在系統外按收入退還書格式設置好後進行套打），打印送人行辦理退稅後，需要在系統內按人行加蓋的章戳上的退庫日期進行退稅銷號。