1988，全縣轄9個區(杜堯、劉冬、大渡口、象嶼、昭潭、官港、勝利、張西、葛公)，3個鎮(杜堯、劉冬、大渡口)，41個鄉(張西、官港、昭潭、陽湖、泥工)。
1992，許村鄉、田亮鄉撤銷，並入杜堯鎮；撤銷長安鄉、長嶺鄉、七裏湖鄉，並入劉冬鎮；楊橋鄉、新亭鄉、八都湖鄉、新豐鄉、慶豐鄉撤銷，並入大渡口鎮；撤銷河鎮鄉、臨江鄉、巷口鄉，合並成立湘粵鎮；撤銷昭潭鄉和永豐鄉，合並成立昭潭鎮；撤銷官崗鄉、石城鄉，合並成立官崗鎮；撤銷勝利鄉、蔣壩鄉，合並成立勝利鎮；撤銷張西鄉、王坡鄉、五峰鄉，合並設立張西鎮；撤銷洋湖鄉，設立洋湖鎮；撤銷紅方鄉，並入平原鄉；馬丁鄉被撤銷，並入查橋鄉。
1992行政區劃調整後，全縣轄9個鎮(杜堯、劉冬、大渡口、湘粵、昭潭、官港、勝利、張西、陽湖)和16個鄉(平原、查橋、泥溪、高山、建新、潭埠、白窪、瓦窪)。
1993年，撤銷平原鄉，建立葛公鎮。1994年，撤銷東升鄉，設立龍泉鎮，鎮政府由黃荊港遷至龍泉。
65438至0995，田亮鄉與杜堯鎮分離；楊橋鄉、慶豐鄉與大渡口鎮分離；將紅方鄉與葛公鎮分開；王坡鄉與張西鎮分開；七裏湖鄉與劉冬鎮分開；石城鄉和關崗鎮是分開的。行政區劃調整後，全縣轄11鎮(杜堯、劉冬、大渡口、湘粵、昭潭、龍泉、官崗、勝利、張西、陽湖、葛公)和21鄉(查橋、泥溪、高山、建新、潭埠、白鹿)。
2001，撤銷田亮鄉，並入杜堯鎮；楊橋鄉、慶豐鄉撤銷，並入大渡口鎮。全縣村委會由2000年底的360個減少到358個:張西鎮六聯村、沿河村、復興村合並為六聯村。
截至2004年底，東至縣轄11鎮(杜堯、劉冬、大渡口、勝利、張西、陽湖、葛公、湘粵、官港、昭潭、龍泉)和18鄉(瓦隆、白鹿、潭埠、王坡)。
2007年2月1日，省、市政府正式批準東至縣鄉鎮行政區劃調整方案:原11鎮、18鄉調整為12鎮、3鄉。將查橋鄉和建新鄉並入杜堯鎮。將七裏湖鄉的整個建制並入劉冬鎮。調整後的劉冬鎮轄15個村(居)委會。將瓦龍鄉整建制並入勝利鎮。調整後的勝利鎮轄21個村委會。將王坡鄉、炭步鄉、白窪鄉的整個建制並入張西鎮。調整後的張西鎮轄26個村(居)委會。將高山鄉整建制並入洋湖鎮。調整後的陽湖鎮轄14個村委會。將紅方鄉建制並入葛公鎮。調整後的葛公鎮轄16個村委會。將石城鄉整建制並入關崗鎮。調整後，官港鎮下轄的16個村委會將鐵爐鄉全系統並入龍泉鎮。調整後的龍泉鎮轄15個村(居)委會。西灣鄉和泥溪鄉整建制合並成立泥溪鎮，轄13個村委會。黎安鄉和穆塔鄉合並為新的穆塔鄉，轄13個村委會。合並馬坑鄉和花園裏鄉全建制，新設花園裏鄉(現更名為花園裏鄉)，轄14個村委會。保留大渡口鎮、象嶼鎮、昭潭鎮、青山鄉。東至縣，皖西南門戶，位於長江皖江段南岸頭，地跨北緯29° 34-30° 30′，東經116° 39-118′。東與貴池區、石臺縣、祁門縣接壤，南、西南與江西省景德鎮市和浮梁、鄱陽、彭澤縣接壤，西北與安慶市、懷寧、望江縣隔江相望。毗鄰江西。西部和北部是長江沖積平原，東部和南部是海拔較低的丘陵。
縣城南北長125公裏，東西寬82公裏。長江東流，海岸線85公裏。縣城距省會合肥245公裏。國土面積3261平方公裏，是安徽省最大的縣之壹，占安徽省總面積的2.3%。東至是水資源豐富的特大縣之壹，水域面積占東至縣的1/3，構成了東至壯美而富有特色的濱水生態環境，水域面積1.023.6平方公裏，覆蓋率35.1.3%。
東至縣境內有7條獨立河流(杜堯河、黃幹河、龍泉河、象嶼河、英山河、巷口河、白坭河)440條支流，全長1，982.45km，總匯水面積3069.1.7 km2..10公裏以上總長度450.75公裏的支流29條，10公裏以下總長度1226.6公裏的支流411條。長江，世界第三長河，流入中國85公裏。東至縣生態公益林面積62906.7公頃，包括湖泊、河流、水庫等濕地面積22419公頃。占東至縣國土面積的41.54%，其中自然濕地12234公頃，人工濕地10185公頃，享有“濕地城市”的美譽。
東部有住房和城鄉建設部批準的金聖湖濕地公園和東至縣林業局建立的黃泥湖濕地公園、腰渡河濕地公園和大渡口長江濕地。東至縣錦江湖生態優美，是首批國家生態經濟示範區和“中國21世紀”先導區之壹，人與自然和諧相處，生態環境優良。
自東向南為山地，森林豐富，植物多樣，森林覆蓋率達58.7%。北部為長江沖積平原，河湖縱橫交錯。有國家級珍禽自然保護區金聖湖，水面20萬畝。是中國白頭鶴最大越冬種群的棲息地，其中越冬的東方鶴占世界總數的1/8，國家壹級保護鳥類有6種。東部的珍禽主要有濱鳥、扇尾沙雛、天鵝、白枕鶴、丹頂鶴、灰鶴、紅隼、紅嘴鷗、白鸛、劍士、白鸛、小翠鳥、金光、白腰、大鴇。
東至是安徽省水產重點縣，優勢水產品生產基地，沿江漁業高產高效示範區。境內有三大水系:黃幹、杜堯和龍泉。東至縣現有漁場23個，其中中央、省、縣三級聯合漁場1個，國有漁場1個，小龍蝦養殖協會1個，漁業合作社1個，省級垂釣休閑基地2個，村級個體漁場20個。東至縣樹種資源豐富。根據1986的普查，* *共有木本植物616種。主要包括:杉木、三尖杉、池杉、水杉、馬尾松、羅漢松、火炬松、濕地松、側柏、圓柏、青檀、國槐、樟樹、懸鈴木、楓樹、楓楊、楊柳、烏桕、楝樹、楸樹、麻櫟。
東至縣立木總蓄積量為7962560立方米，其中林地7790019立方米(喬木林7744773立方米，疏林9326立方米，散生樹35920立方米)，周邊樹木1立方米。