符合條件的，市級國稅機關所得稅管理辦公室給以確認，明確享受稅收優惠的期限，並返還壹張企業所得稅減免稅備案表，企業需將此表送主管稅務機關。
壹般情況市級國稅機關確認享受稅收優惠的期限從高新技術企業認定有效期起，但如企業報送資料晚，有可能從國稅機關確認後有效。
申請流程：
1、 首先，企業要自我評價。企業應對照《認定辦法》第十條進行自我評價。認為符合條件的在“高新技術企業認定管理工作網”進行註冊登記。
2、其次，按要求填寫《企業註冊登記表》，並通過網絡系統上傳至認定機構。
3、下壹步是企業要準備並提交材料。
企業根據獲得的用戶名和密碼進入網上認定管理系統，按要求將下列材料提交認定機構：
《高新技術企業認定申請書》、企業營業執照副本、稅務登記證書（復印件）、經具有資質並符合本《工作指引》相關條件的中介機構鑒證的企業近三個會計年度研究開發費用（實際年限不足三年的按實際經營年限）、近壹個會計年度高新技術產品（服務）收入專項審計報告、經具有資質的中介機構鑒證的企業近三個會計年度的財務報表（含資產負債表、利潤及利潤分配表、現金流量表，實際年限不足三年的按實際經營年限）、技術創新活動證明材料，包括知識產權證書、獨占許可協議、生產批文，新產品或新技術證明（查新）材料、產品質量檢驗報告，省級（含計劃單列市）以上科技計劃立項證明，以及其他相關證明材料。
4、經認定合格的高新技術企業，自認定當年起可依照相關規定享受稅收優惠政策。
需要註意的是，高新技術企業資格不是終身制，高新技術企業資格自頒發證書之日起生效，有效期為三年。
高新技術企業資格期滿前三個月內企業應提出復審申請，不提出復審申請或復審不合格的，其高新技術企業資格到期自動失效。