負責政務、文電處理和重要會議的組織協調，以及機要通信和對外聯絡接待；負責新聞宣傳和組織政策研究；負責整個社會治安的綜合管理和保密工作；負責局機關文件檔案管理、辦公自動化、政府信息和局網站信息發布；負責制定總體網絡管理計劃，監督檢查網絡運行狀況，協調解決相關管理工作；指導機關行政服務和下屬單位的文秘保密工作；負責歷史記錄工作；負責人民來信來訪。
財務處
貫徹執行國家財政經濟工作的方針、政策和法令，研究制定財務管理、會計和內部管理制度；參與局機關發展資金使用的各種研究、討論和決策；負責總體年度財務計劃的綜合平衡，編制年度預算和決算；組織建立項目庫和專家評審，組織指導各單位會計電算化的運行和升級；根據局的發展規模和強度，統籌規劃局各項資金的積累、利用和儲備；規範和指導會計基礎工作，考核和分析經濟效益，監督各項支出。
基礎測繪辦公室(綜合統計辦公室、技術監督辦公室)
會同有關部門研究制定本省測繪發展戰略和中長期規劃；組織協調國家基礎測繪項目的申報和基礎測繪、地籍測繪等重大測繪項目的實施；負責編制全省基礎測繪和其他重大測繪項目規劃並組織實施；負責全局市場任務的組織協調，會同有關部門組織管理行政區域界線測繪工作；負責審批航空攝影計劃和遙感項目；組織本省基礎測繪項目的招標投標；負責全球測繪生產統計年報的編報工作；負責管理全省基礎測繪項目和國家、省重大測繪項目的委托驗收工作；負責組織實施國家、省有關測繪技術和產品質量的法律法規；負責全省測繪行業計量標準的監督管理和行業生產質量管理監督；負責對測繪質量檢驗和儀器檢驗機構的監督和指導。
行業管理辦公室(政策法規辦公室)
組織制定本省測繪工作相關的地方性法規、政府規章和規範性文件；負責國家和省頒布的法律、法規和規章的實施和監督檢查；負責編制測繪立法規劃和地方性法規、規章及規範性文件；負責全省測繪資格考試、測繪資格年度註冊和日常監督檢查工作；負責測繪項目登記和測繪作業許可證的發放；負責全省測繪市場的監督管理；負責本省測繪行業的統計工作；指導城市測繪行業管理工作；承辦行政復議和行政訴訟；組織和指導全省測繪法制宣傳、教育和培訓工作。
地圖審查管理辦公室(執法小組)
負責全省地圖的編制、出版、審核和管理工作；管理地圖命名工作；負責對國家測繪法律法規的實施和遵守情況進行檢查，查處違反測繪法律法規的行為，組織和指導本省測繪行政執法工作。負責本省測量標誌的管理工作。
科技司(國際合作司)
組織擬訂全省測繪科技政策和我局中長期科技規劃，負責組織全省重大測繪科技項目攻關的壹般科研項目的制定、檢查、成果鑒定、獎勵、統計和推廣；管理全省出國測繪科技合作與交流，負責局機關外事管理，負責國際項目交流與合作。
成果應用辦公室(信息辦公室)
指導和監督全省各類測繪成果的收集、歸檔和使用；審核本省重要地理信息數據；調查了解省內各行業對空間信息基礎設施的需求，協調組織應用服務；負責監督和指導測繪資料管理工作。負責全省重要地理信息的發布。
人事處
負責機構編制、幹部人事、勞動工資、勞動保險福利、社會保險、出國政審等管理工作。局機關及下屬單位；組織管理全省測繪行業高級職稱和技術工人等級評定工作；負責人才的引進和開發；負責全球員工的年度考核；組織和指導全省測繪專業人才培養和測繪工作者教育培訓工作；負責統籌管理幹部職工的業務培訓、繼續教育和學歷教育計劃；負責“落實政策人員”的信訪工作。
國有資產管理處(基建設備處)
負責國有固定資產的使用、加工、統計和計劃管理；負責編制整體基礎設施設備和材料的年度投資計劃；負責局機關重點建設項目的實施和設備技術改造、更新的實施；負責重大技術裝備使用的跟蹤檢查和效益分析；負責局基建、設備、物資的年度統計。
直屬機關黨委(局工會、局團委、局精神文明辦、局計生辦)
負責全面黨群工作；組織全面的思想政治工作，負責文明單位的全面建設；負責整體宣傳工作；負責指導全局各單位黨的基層組織建設和全局黨員幹部的政治理論教育和管理工作；負責全面的計劃生育工作。
紀檢監察審計局
負責監督檢查局機關、下屬單位和黨員領導幹部貫徹執行黨的方針、政策、國家法律、法規和上級有關政策規定的情況；指導局機關和直屬單位的紀檢監察工作；協助黨風廉政建設，受理紀檢監察對象的舉報、投訴和申訴，並進行調查處理；負責監察局下屬單位財務預算、決算和財務收支、實物效益、經濟合同的執行情況，負責下屬單位主要行政領導的離任審計、在職審計和工程審計；負責各單位經濟合同、協議、經濟效益、專項資金、收費行為的審核；配合有關部門對損害國家利益的行為進行專項審計。
黑龍江測繪局機關服務中心
在局辦公室的指導下工作，其主要職能是根據局機關各個時期的中心工作，研究制定局機關服務中心的工作計劃和具體措施。協助局辦公室為局重要會議提供服務，安排公務接待和各項活動。做好機關後勤管理工作。做好局方的交通、通訊和保障工作。負責局機關財務室、管理科、打字室的管理工作。完成領導臨時交辦的所有任務。
離退休幹部辦公室
認真學習宣傳中央和上級關於退休的方針政策；負責退休人員的統籌管理；負責指導和檢查直屬單位的離退休工作；負責組織和指導離退休人員的具體工作；負責離退休幹部學習政治理論、傳達文件等重要活動的組織工作；開展適合老同誌特點的參觀學習、健康講座等健康群體活動；對離休幹部進行家訪慰問，看望住院病人，了解和反映他們的意見和建議；管理老幹部活動室，為老幹部提供優質服務；負責局機關退休人員的醫療保險工作；完成局領導交辦的其他任務。
工業發展司
負責研究、制定和實施工業發展宏觀規劃、工業發展戰略及相關政策；負責制定局機關地理信息產業園規劃和園區開發建設；負責園區企業管理，建立健全園區管理相關制度，提供相應政策服務，確保國有資產保值增值；負責園區招商引資；負責本局財產的開發和管理。