在確定目標企業以後，並購企業最關心的就是按照會計制度的相關會計確認方法及資產評估方法對目標企業的價值做出合理的估計，以評估的價值作為雙方進行交易的底價。影響價值評估最終結果的壹個重要因素就是收購企業獲得的目標企業實際狀況的相關信息。信息不對稱導致企業價值評估難於做到非常準確。價值評估取決於並購企業所用信息的質量，而信息的質量又取決於下列因素：目標企業是上市公司還是非上市公司；並購企業是善意並購還是惡意並購；準備並購的時間；目標企業審計距離並購時間的長短，等等。由於我國會計師事務所提交的審計報告水分較多，上市公司信息披露不充分，嚴重的信息不對稱使得並購企業對目標企業資產價值和盈利能力的判斷很難做到非常準確，在定價中可能接受高於目標企業價值的收購價格，導致並購企業支付更多的資金或更多的股權進行交易。
財務風險二、流動性風險
並購占用並購企業大量的流動性資源，將導致並購企業資產的流動性降低。並購後，並購企業可能由於債務負擔過重，缺乏短期融資，導致出現支付困難。當並購企業采取現金收購時，首先考慮的是資產的流動性。流動資產和速動資產的質量越高，變現能力越強，並購企業越能順利、迅速地獲取收購資金。這同時也說明，並購活動占用了企業大量的流動性資源，從而降低了並購企業對外部環境變化的快速反應和調節能力，增加了企業的經營財務風險。如果自由資金不多，並購企業必然采取舉債的方式，通常目標企業的資產負債率過高，使得並購後的企業負債比率和長期負債都有大幅度上升，資產的安全性降低。若並購方的融資能力較差，現金流量安排不當，則流動比率也會大幅度下降，影響其短期償債能力，使並購方資產流動性減弱，進而影響其借債能力和盈利能力。
財務風險三、融資風險
企業並購需要籌集大量資金，將給並購企業帶來融資財務風險困難。融資的方式及其結構、資金的使用方式都會產生財務風險。
1、融資方式安排財務風險。以自有資金進行並購雖然可以降低融資成本和財務風險，而且手續簡便，可以作為其他融資的保證，但是大多數企業在並購時都存在自有資金不足的問題。目前，我國企業自有資金普遍不足，可能造成的機會損失大，尤其是抽調本企業寶貴的流動資金用於並購，可能造成企業正常周轉困難。以銀行貸款融資可以彌補資金不足，但是我國企業的平均負債率比較高，再向銀行融資能力有限，銀行也加大了對貸款的審查和控制，只有實力強、效益好、財務風險低的企業才能得到銀行的支持，並附帶其他限制條件；而且債券融資需要嚴格復雜的審批，有相關的規模和指標限制，通過發行債券獲得的資金由於國家法律對於用途的嚴格規定，也難用於並購支付；加上我國二級交易市場的發育程度不高，制約了債券的流動性，限制了投資者資金的投入，阻礙了擴大並購融資債券的發行。
2、融資結構財務風險。企業並購所需要的資金很難通過單壹的方式解決。在多渠道籌集資金的情況下，企業面臨融資結構的風險。融資結構包括短期債務資本和股權資本結構。債務資本包括短期債務與長期債務結構。
3、所融資金的使用財務風險。企業融資的資金主要用於並購價格、並購費用及增量投入成本。在企業並購資金的使用上，企業首先安排的是並購費用，這在並購成本中所占的比例較小；其次是支付目標企業的買價，買價可以壹次性支付，也可分期支付。在分期支付的情況下，不但可以緩解企業融資的壓力，還可以在目標企業出現不確定性因素的情況下，通過毀約以減少損失的程度；最後是支付增量投入資金，尤其是生產經營急需的啟動資金、下崗職工的安置費用，等等。在資金的使用方面，不僅在時間上要按照順序保證三個方面的資金需要，而且在空間上要做出合理的分配。任何安排不當，都會影響並購效果的如期實現。
財務風險四、支付風險
在確定了並購定價和並購方式後，選擇何種支付方式也很重要。並購主要有四種支付方式：現金支付、股權支付、混合支付和杠桿收購。不同支付方式選擇帶來的支付財務風險thldl.org.cn最終表現為支付結構不合理、現金支付過多從而使得整合運營期間的資金壓力過大等。
現金收購是最簡便的並購方式，但卻並非是最佳的選擇，因其弊端是顯而易見的。首先，現金支付工具的使用，是壹項巨大的即時現金負擔，公司所承受的現金壓力比較大；其次，使用現金支付工具，交易規模常會受到獲現能力的限制；再次，從被並購者的角度來看，會因無法推遲資本利得的確認和轉移實現的資本增益，從而不能享受稅收優惠，以及不能擁有新公司的股東權益等原因，而不歡迎現金方式，這會影響並購的成功機會，帶來相關的風險。
換股並購雖然成本較低，但程序復雜。對於主並方而言，換股可使其免於即時支付的壓力，把由此產生的現金流量投入到合並後企業的生產和經營中；對於被並方來說，換股可以使其股東自動成為新設公司或後續公司的股東，分享合並後企業的盈利增長；此外，由於推遲了收益確認時間，可延遲交納資本利得稅。但換股並購也有壹些缺陷，如改變了企業的股權結構，稀釋大股東對企業的控制權，可能攤薄每股收益和每股凈資產。如果主並方第壹大股東控股比例較低，而被並方又股權較集中，則可能出現主並方為被並方所控制的情況。
除了上述幾種主流支付方式外，賣方融資和以現金、股票、認股權證、可轉換債券等多種支付工具的混合支付也逐漸被采用，且呈逐步上升的趨勢。
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