1.納稅人應根據自身經營情況和有關稅收規定，判斷是否符合優惠項目規定的條件，采取“自行判斷、申報享受、留存相關資料備查”的方式享受優惠項目。符合稅收優惠條件的，可通過填報A107000系列表格享受稅收優惠。
2.企業所得稅年度申報表主表(A100000)第13行的“利潤總額”應與財務報表中的“利潤總額”保持壹致，基本信息表“總資產103”平均值計算公式中的總資產期初和期末值應與財務報表中的總資產期初和期末值保持壹致。
3.壹般情況下，企業所得稅年度申報表(A100000)主表第1行“營業收入”和第11行“營業外收入”合計數應大於當年累計銷售收入。企業基本信息表(A00000)是必填項。完成企業基本信息表(A000000)並保存後，才能進入下壹步，添加其他申報單。
4.壹般情況下，房地產開發企業年度納稅申報表主表(A100000)第1行“營業收入”應大於等於視同銷售及房地產開發企業具體業務納稅調整明細表(A105010)第27行確認的銷售收入。
5.正常情況下，職工薪酬支出及納稅調整明細表第1行、第1列的“工資薪酬支出-賬戶金額”不應為0。
6 .納稅人行業、財務會計系統備案時，股東信息與實際情況不符或信息缺失的，應當及時修訂。
7.《企業所得稅年度納稅申報表基本信息表》(A000000)中的“基本經營情況”是所有企業的必填項；“涉稅事項信息”為選填項，有或有相關事項的企業必須填寫；“主要股東及分紅”為小型微利企業的豁免項目，非小型微利企業必須填寫。
8.納稅人進行年度申報時，企業所得稅年度納稅申報基本信息表(A000000)中的“104從業人員”與季度預繳申報表中填報的全年平均從業人數不壹致，小型微利企業標誌發生變化的，應先更正第四季度預繳申報表。
9.小型微利企業無需填報壹般企業利潤表(A101010)、金融企業利潤表(A101020)和壹般企業成本表(A102065438)事業單位和非政府非營利組織收支表(A103000)和期間表除上述表格和項目外，小型微利企業可根據自身經營情況選擇表格填寫。表格中規定的事情沒有發生，所以沒有必要填寫。
10.納稅人的政策性搬遷事件可視為從搬遷年度的次年起至搬遷完成前壹年止停止生產經營活動的年度，可從法定損失結轉補償期內扣除。企業所得稅年度納稅申報基本信息表(A000000)中的“216政策性搬遷停產停業無收入年度”應為“是”。
11.無論是否進行稅務調整，只要資產發生折舊或攤銷，納稅人都需要填寫資產折舊、攤銷和稅務調整清單(A105080)。
12.所有納稅人都必須填寫彌補虧損明細表(A106000)。虧損彌補表中的上壹年度虧損數由系統自動帶出。納稅人如對第八欄“本年應彌補虧損金額”有疑問，請向主管稅務機關咨詢。
無論是否享受優惠政策，在有效期內認定為高新技術企業的納稅人，均需填寫高新技術企業優惠情況及清單(A107041)和R&D費用加計扣除清單(A107012)。