1、服務的對象不同。
眾創空間是面向所有創業創新的群體;
企業孵化器是面向特定的服務對象，是針對新創辦的科技型中小企業。
2、服務方式不同。
眾創空間能向初創企業提供其在萌芽期和成長期的便利，比如金融服務、工商註冊、法律法務、補貼政策申請等，幫助其健康而快速地成長。
眾創空間還可通過沙龍、訓練營、培訓、大賽等活動促進創業者之間的交流和圈子的建立，提供場地、舉辦活動，能夠方便創業者進行產品展示、觀點分享和項目路演等。促進創業者之間的互幫互助、相互啟發、資源***享，達到協同進步的目的，通過“聚合”產生“聚變”的效應。
企業孵化器是為新創辦的科技型中小企業提供物理空間和基礎設施，提供壹系列的服務支持，進而降低創業者的創業風險和創業成本，提高創業成功率，促進科技成果轉化，培養成功的企業和企業家。
3、功能和作用不同。
眾創空間是順應創新2.0時代推動大眾創業、萬眾創新的形勢，構建面向人人的創業服務平臺，對於激發億萬群眾創造活力，培育包括大學生在內的各類青年創新人才和創新團隊，帶動擴大就業，打造經濟發展新的“發動機”，具有重要意義。
企業孵化器很好地培育了科技型中小企業的發展，為中國高新技術產業發展提供了源源不斷的後備力量，培育出了壹大批科技型企業和企業家，為經濟發展和產業結構調整做出了貢獻;為鼓勵科技人員創業和創造新的就業機會，維護社會穩定做出了貢獻。
擴展資料：
企業孵化器主要作用：
中國第壹個孵化器專業博士顏振軍認為企業孵化器在企業家創業過程中節省時間、少走彎路、營造創業者聚集效應，提高創業成功率；
廈門大學的博士認為孵化器“通過為初創企業提供生產研發空間以及基礎設施服務來降低創業成本並提高效率；連接風險投資機構和初創企業，降低雙方存在的信息不對稱；提供壹種合理分攤創業者創業成本和創業風險的工具”。
美國全美孵化器協會研究資料顯示，成功孵化器的服務項目包括：網絡支持；互聯網或信息技術服務；咨詢；聯系戰略合作者；商業計劃支持協助獲取天使投資或風險投資；聯系大學研發機構；幫助可靠的學生實習或就業；管理團隊發展；財務管理支持；知識產權支持；法律服務；提供專業實驗設施；
參考資料：