內部審計的內容主要是檢查內部控制的執行情況和經濟活動取得的經濟效益，提出各種改進措施，根據企業的戰略目標、單位內部定額、計劃指標和內部管理制度，評價企業內部受托經濟責任的履行情況。
內部審計的類型包括財務審計、經濟效益審計、業務審計和管理審計。外部審計以獨立審計準則為基礎，主要審查企業經濟活動的真實性和合法性。
對被審計單位會計報表的合法性和公允性發表審計意見，未觸及經濟效益審計和管理審計。因此，內部審計比外部審計需要更多的深度和廣度。
第二，審計的委托人不同。
內部審計人員作為企業管理當局的參謀和助手，處理企業生產經營管理活動中的問題，幫助各級管理者有效履行職責。他們的主要和直接服務對象是組織內的各級管理者，包括企業管理當局和董事會。
通常委托外部審計師對企業的財務會計報表進行年度審計，其服務對象是與企業利益相關的社會各界，包括股東、銀行、債權人、政府和潛在投資者。當然，這也不排除他們的意見被企業管理當局和董事會采納的情況，但這是次要的，不是它的主要使命和目的。
第三，審計職能的範圍不同。
內部審計的作用壹般僅限於內部組織。只有采納正確的審計結論和建議，並及時采取改進行動，才會產生建設性的實際效果。內部審計人員對生產經營管理的意見和看法壹般不對外公開，具有壹定的保密性。
外部審計機構對財務會計報表發表的審計意見和結論應當公開，客觀上起到了社會公正的作用，其覆蓋面比內部審計要廣得多。
第四，與內部控制的關系不同。
外部審計師的興趣主要集中在內部會計控制和對會計信息的真實性和完整性有實質性影響的相關控制，而內部審計師則非常關註包括內部會計控制在內的整個內部控制體系。
而且，兩者的出發點不同。外部審計師關心內部控制，因為內部控制影響他們設計的審計程序的性質和實質性測試的範圍，而實質性測試的範圍次於他們對財務和會計報表的獨立意見。
內部審計人員關註內部控制的目的是檢查和評價內部控制制度的適當性和有效性，並針對控制缺陷提出加強控制的意見和措施。
第五，審計的範圍和時間不壹樣。
內部審計的範圍涉及企業生產經營管理的各個領域，既可以基於正式記錄和文件，也可以基於非正式記錄和文件；內部審計通常對單位內部機構采取定期或不定期審計，時間安排較為靈活。
外部審計通常是定期審計，每年對被審計單位的會計報表進行壹次審計，其審計範圍主要限於財務會計領域及其相關的內部控制制度。
重點是那些對財務會計報表的合法性和公允性有實質性影響的重大事項，它只能依靠正式的記錄和文件。因此，內部審計在審計對象範圍上比外部審計更廣泛，在審計時間上也更靈活。
第六，審核程序不同。
內部審計的工作程序通常是按照部門或業務所在地來設計的，會計記錄和報表的檢查只是其工作的壹小部分，大部分時間和精力都集中在對內部控制制度和工作質量的檢查和評價上；外部審計的程序壹般是針對財務會計報表所列項目而設計的。
大部分時間用於檢查和驗證報表中各項目的余額是否真實、準確、可靠，確認所采用的會計原則和政策是否公允。
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