K.O.F.96發布會的成功不僅激起了戰鬥潮流，也引起了幾個龐大企業的興趣，並期望以贊助商的名義舉辦K.O.F.97，K.O.F.97的勢頭越來越強。在洶湧的人群下，K.O.F.97正式實施並舉行。大會決定舉行後，世界各地的武術學校將陸續雲集。比賽開始前，與有著長期婚姻關系的女友薛出現了，而非常崇拜的徒弟也出現在公眾面前。草薙京在草薙教了他古代武術。
經過激烈的競爭，大會結束了，這時八神庵和蓮娜的邪惡勢力突然爆發了。在擊敗逃跑的兩人後，七枷社、夏爾米和克裏斯出現了，他們在會議中脫穎而出。他們的真實身份原來是蛇族的四大天王。經過激烈的戰鬥，他打敗了三個人，而此時大蛇在克裏斯的身體幫助下成功復活！傳說中最強黑暗力量的掌控者——大蛇大蛇神終於出現了！最終，大蛇被草薙京、八神庵和神樂千鶴這三個神器打敗了。
後記:身受重傷的八神庵被神樂千鶴救出，而身受重傷的草薙京被N.E.S.T.S .活捉，成為制造克隆體的材料...(拳皇音巢開始介紹)
擴展數據:
選擇以下隊伍通關，妳會看到壹個特別的結局。
1.領先隊伍:草薙京、二階堂紅丸、達門五郎(用草薙京打敗大蛇，結局將是對陣八神庵)。
2.三神器隊:草薙京、八神庵、神樂千鶴(《拳皇97》正統結局)
3.指導團隊:草薙京，矢吹真吾和第三個人是自由的，只要他們不是八神庵或利亞納。
494名女戰士:阪崎百合，不知火舞，金。
5.老牌明星隊:拉爾夫、克拉克、雅典娜馬公。
6.SNK巨星:草薙京，特裏，阪崎良
7.邊緣隊:二階堂紅丸、董璋、金家攀。
8.第壹組:特裏、董璋和瑪麗。
9.家庭組:陳國漢，蔡寶健和山崎龍二。
近地天體小組:草薙京，不知火舞，比利。
註:從第四個開始，所謂特別的結局，其實就是在五線譜前面會插壹張特別的圖。語言的後三個街機或主機版本只能看日文，SS或PS版本必須買日文。