三級分支機構需要備案嗎？

需要備案。根據《國家稅務總局關於印發〈跨地區業務匯總征收企業所得稅管理暫行辦法〉的通知》(國稅發〔2008〕28號)第九條規定，三級及以下分支機構不在當地預繳企業所得稅，但其營業收入、員工工資和資產總額統壹計入二級分支機構。所以三級分支機構只需要向主管稅務機關備案，不需要季度預繳。