1.是作為生物信息學最重要的專門期刊了。2012年度IF=5.468
2.另外還有Briefingsin，這個雜誌每年的發稿量少，最近幾年IF波動很大，第壹年24，後來到9，2012年度IF=5.202。
3.稍次壹點的雜誌，如BMC，也是生物信息學的專刊。2012年度IF=3.447
4.對於計算向的生物信息學，PLOSBiology是壹個很好的期刊。2012年度IF=5.215
5.除此之外，NatureMethod，也會有生物信息學相關的方法發表。2012年度IF=19.276
生物信息學相關的文章不壹定要發到專門的生物信息學雜誌，因為生物信息學作為壹個工具，已經融入到很多生物問題的研究中，而不僅僅是壹門孤立的學科了。
PLOSBiology也是很好的雜誌，2012年度IF=11.452。PLOSOne也會經常有生物信息學文章，但被批灌水太多，算不得牛刊，2012年度IF=4.092。