水務集團與自來水公司的區別在於單位性質、負責工作、利潤來源的不同：
1、單位性質的不同
水務集團：水務投資集團是隸屬於國家的國有獨資企業。
自來水公司：自來水公司是壹家經營單位，主要是公私合營。
2、負責工作的不同
水務集團：負責水源統籌，汙水處理等工作，也可以理解為保護以及合理分配水源的國企。
自來水公司：負責安裝管線、供水、維護。壹般自來水公司至少包含壹家自來水廠，有的可能有若幹家自來水廠，公司對水廠進行管理。
3、利潤來源的不同
水務集團：水務集團主要依靠完成政府下達的汙水處理指標獲取利潤。
自來水公司：自來水公司主要向居民收取供水費和安裝費。