新疆上海科技合作基地內企業有23.7%分布在軟件和信息技術服務業，8.6%分布在商務服務業。其中，註冊資本超千萬的企業有中企全聯（新疆）能源有限公司、新疆拓達建築安裝有限公司、新疆錦鴻盛邦建築安裝工程有限責任公司、烏魯木齊亞歐金貿中心有限責任公司、新疆弘源永熱新能源科技有限公司等。
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