計算機信息系統環境下審計技術方法與手工環境下傳統的審計技術方法相比，相應增加了計算機技術的內容。對信息系統審計的方法既包括壹般方法即手工方法，也包括應用計算機審計的方法。例如，北京時代新威信息技術有限公司以信息系統審計服務、信息系統審計工具研發和信息系統審計師培訓為核心業務是信息系統審計解決方案提供商，信息系統審計的壹般方法主要用於對信息系統的了解和描述，包括：面談法、系統文檔審閱法、觀察法、計算機系統文字描述法、表格描述法、圖形描述法等。應用計算機的方法壹般用於對信息系統的控制測試，包括：測試數據法、平行模擬法、在線連續審計技術(通過嵌入審計模塊實現)、綜合測試法、受控處理法和受控再處理法等。應用計算機技術的審計方法主要是指計算機輔助審計技術與工具的運用。但不能把計算機輔助審計技術與工具的使用過程與信息系統審計等同起來。在信息系統審計的過程中，仍然需要運用大量的手工審計技術。
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