在正采雲電子開標過程中，代理機構負責組織和管理開標活動，並有權查看和管理招標文件。在開標過程中，代理機構可以檢查投標人的商務投標文件和投標報價。這是為了保證開標的透明和公正，以便評標委員會對投標報價進行評估和比較。