1．申報。企業登錄“重慶市科技型企業管理系統”（以下簡稱“管理系統”），首先進行註冊，經所在區縣科技行政主管部門審核通過後，填寫《重慶市科技型企業信息表》，並且上傳“三證合壹、壹照壹碼”營業執照、上年度會計報表（資產負債表、現金流量表和損益表，並且需專項列出研究開發費用）、納稅申報表和增值稅中銷項稅的納稅憑證等證明材料。
2．審核。區縣科委負責對轄區內申報企業的信息和上傳材料進行真實性審核，符合條件的在線推薦提交至市科委。
3．復核。第三方機構負責對區縣推薦提交的企業申報材料進行復核，符合條件的納入重慶市科技型企業培育庫統壹管理。
4．更新。入庫科技型企業應當於每年第壹季度在管理系統更新統計信息，由區縣科委進行審核，第三方機構進行復核。符合條件的，才能繼續享受有關科技創新扶持政策。