重慶市衛生信息中心是重慶市衛生局直屬的衛生專業信息機構，同時承擔重慶市衛生局電子政務系統的建設和維護，履行整合全市醫療衛生信息資源的政府職能。該中心的前身是重慶醫學信息研究所。經過20多年的建設，現已發展成為西南地區大型綜合性醫療衛生專業信息機構。為適應新時期加快衛生信息化發展建設的要求，2002年7月更名為重慶市衛生信息中心。中心擁有完善的現代信息技術手段，良好的健康信息收集、整理、分析、研究、傳遞和推廣服務條件，專業技術力量雄厚。中心設有綜合信息部、醫學圖書館、文獻檢索室、計算機室、《重慶醫學》編輯部、《國外臨床生化與檢驗學》編輯部、檢驗醫學與臨床編輯部、綜合業務拓展部等業務部門。是重慶市唯壹壹家衛生部指定的醫藥衛生查新咨詢服務機構。
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