1.登錄電子稅務局，點擊我要辦稅，然後點擊辦理事項；
2.進入辦理涉稅事項界面，選擇變更登記，將頁面拉到底部，點擊辦理；
3.頁面彈出稅務變更登記表的描述，點擊頁面右下角的下壹步；
4.頁面彈出填寫變更稅務登記表的界面。在變更項目中，選擇財務總監的姓名，變更前的內容會自動彈出需要移除的財務總監，變更後的內容會填入更換的財務總監。填寫完畢後，點擊添加。
《中華人民共和國稅收征收管理法》第二十條。
從事生產經營的納稅人的財務會計制度、財務會計處理方法和會計軟件應當報送稅務機關備案。
納稅人、扣繳義務人的財務、會計制度或者財務、會計處理方法與國務院財政、稅務機關的有關稅收規定相抵觸的，應當按照國務院財政、稅務機關的有關稅收規定計算應納稅款、代扣代繳稅款。
法律分析:公司要變更財務控制人，需要到當地主管的國稅局和地稅局進行變更，兩個稅務局都要申請變更，否則出現問題沒有有利依據。