《國家稅務總局關於增值稅若幹稅收政策問題的批復》(國稅函〔2001〕248號)規定：屬於增值稅壹般納稅人的棉花經營單位向農業生產者購進免稅棉花，可根據農產品收購憑證註明的收購金額按13％的稅率計算抵扣進項稅額。這裏的“棉花經營單位”不包括良種棉加工廠和紡織企業。良種棉加工廠和紡織企業直接向生產者購進的免稅棉花應按10％的稅率抵扣。《財政部、國家稅務總局關於棉花進項抵扣有關問題補充通知》（財稅[2001]165號）規定：自2001年7月1日起，增值稅壹般納稅人（包括良種棉加工廠和紡織企業）直接向農業生產者購進的免稅棉花，均可根據買價按13%的抵扣率計算進項稅額。所以，在2001年7月1日前該廠收購的棉花只能根據買價按10%的抵扣率計算進項稅額，而自2001年7月1日起，則可按13%的抵扣率計算進項稅額。
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