1、征收方式的不壹樣：
個體戶工商戶：定期定額交稅。小微企業：查賬征收。
2、稅種不壹樣：
個體工商戶繳納的是個人所得稅；小微企業繳納的是企業所得稅。
3、稅收的優惠不同：
小微企業享受企業所得稅稅收優惠。按照財稅2017年43號文的規定：自2017年1月1日至2019年12月31日，將小型微利企業的年應納稅所得額上限由30萬元提高至50萬元，對年應納稅所得額低於50萬元（含50萬元）的小型微利企業，其所得減按50%計入應納稅所得額，按20%的稅率繳納企業所得稅。
個體工商戶則沒有優惠。
參考資料：
百度百科-個體工商戶納稅
百度百科-企業所得稅