管理信息系統除了具備信息系統的基本功能外，還具備預測、計劃、控制和輔助決策特有功能。
具體是：
（1）數據處理功能。包括數據收集和輸入、數據傳輸、數據存儲、數據加工和輸出；
（2）預測功能。運用現代數學方法、統計方法和模擬方法，根據過去的數據預測未來的情況；
（3）計劃功能。根據企業提供的約束條件，合理地安排各職能部門的計劃，按照不同的管理層，提供相應的計劃報告；
（4）控制功能。根據各職能部門提供的數據，對計劃的執行情況進行監測、檢查、比較執行與計劃的差異，對差異情況分析其原因，輔助管理人員及時以各種方法加以控制；
（5）輔助決策功能。采用各種數學模型和所存儲的大量數據，及時推導出有關問題的最優解或滿意解，輔助各級管理人員進行決策，以期合理利用人財物和信息資源，取得較大的經濟效益。