國家級萬州經濟技術開發區內企業有40%分布在化學原料和化學制品制造業，20%分布在軟件和信息技術服務業。其中，註冊資本超千萬的企業有重慶萬州經濟技術開發（集團）有限公司、重慶迪康中藥制藥有限公司、芯能致行科技（重慶）有限公司等。
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