根據自治區科技廳發布公告顯示在2021年度，內蒙古自治區已完成了六批科技型中小企業入庫工作，內蒙古全區***有831家中小企業登記入庫，其中，呼和浩特市有229家中小企業登記入庫。
呼和浩特中小企業著名的有經開區金宇保靈生物藥品有限公司、內蒙古靈奕高科技(集團)有限責任公司、正耐電氣股份有限公司、內蒙古普澤生物制品有限責任公司、內蒙古和光新能源有限公司等。