1.安全工程理論和方法：研究安全防護的基本理論、方法和技術，包括風險分析、安全規劃、安全罪犯行為分析等。
2.安全管理與評估：研究安全運行控制的方法，包括安全管理體系的建立、安全評估工具的開發等。
3.信息安全技術：研究安全保障技術的各種手段，包括密碼學、網絡安全、安全通信等。
4.智能安全管理技術：研究如何將智能技術應用於安全系統，包括智能控制和智能決策等。
安全系統工程的研究方法主要包括實驗研究、推理研究和仿真研究等。其中，實驗研究以實驗為基礎，探究安全系統工程的理論和方法。推理研究依靠規律性推導和邏輯推理，對安全系統工程的基本問題進行分析探討。仿真研究則利用仿真軟件，通過模擬實驗的方式，研究安全系統的運行狀態和效果。