計費風險預警機制中的黃色預警表示預警級別較高，但不壹定表示計費行為本身存在問題。系統監控可能會出現異常，比如稅務局的系統監控發現異常，導致預警提示。鑒於這種情況，建議進壹步核實具體情況，以確定是否存在實際問題。
黃色預警的嚴重性還表現在開票主體的業務風險和信用風險上。壹旦出現黃色預警，可能會損害企業聲譽，難以獲得信用和合作機會，給企業的經營活動帶來麻煩。黃色預警也可能對市場秩序產生負面影響。比如，虛開發票會導致產業鏈上的串通舞弊，擾亂市場競爭秩序，影響經濟健康發展。