中國綠色食品發展中心對許可使用綠色食品標誌的產品進行統壹編號，並頒發綠色食品標誌使用證書。編號形式為：LB－XX－XXXXXXXXXX或GF×××××× ×× ××××。“LB”是綠色食品標誌代碼，後面的兩位數代表產品分類，最後10位數字含義如下：壹、二位是批準年度，三、四位是批準月份，五、六位是省區，七、八、九、十位是產品序號，最後壹位是產品級別（A級以單數結尾，AA級為雙數結尾）。從序號中能夠辨別出此產品相關信息，同時鑒別出“綠標”是否已過使用期。“GF”是綠色食品企業信息標誌代碼，後面的6位數代表地區代碼，按行政區劃編制到縣級；中間兩位數是認證年份，最後四位數是當年序號。自2009年8月1日起實施新的編號制度。產品編號與企業信息碼過渡期截止日期為2012年7月31日。此後，所有獲證產品包裝上統壹使用企業信息碼。