1，窗口處理。參保人員需攜帶本人身份證或社保卡到南京醫保中心辦理，退休、異地居民需提供異地戶口簿、房產證或其他有效的異地居住材料；長期異地就讀、異地常住人員需提供用人單位或學校、培訓機構蓋章的異地證明材料；選擇省市信息進行異地備案；經辦人員進入系統，生成南京市基本醫療保險異地就醫記錄表；雙方確認並簽字，雙方各執壹份。
2.在線處理。單位管理人員登錄南京市醫療保障局官網，進入“在線服務”通道，為本單位退休職工或在職職工辦理備案；基本信息需要核實，備案後立即生效，單位需要將備案材料歸檔備查。
3，手機處理。通過“我的南京”APP或“全國醫保服務平臺”APP，需要完成實名認證，選擇異地備案的省市信息，錄入系統，生成備案表，雙方確認簽字。
4、特殊時期。通過電話或電子郵件申請備案。以《我的南京》為例。完成實名認證後，進入醫保服務，選擇異地就醫備案。