辦公信息系統也可以根據其服務的組織分為幾個層次。例如，政府辦公信息系統可以分為中央部委、省、市、地、縣。企業在總部、分公司、工廠、車間等各級都有辦公信息系統。每個層次還可以根據其功能劃分為若幹個子系統。
辦公信息系統也可以根據行業的特點分為以下幾種類型:
(1)事務型:主要處理文字處理和事務處理的辦公信息系統。如文字系統、訂單處理、民航訂票、編輯出版、圖書館等。
(2)專業型:客戶為專業機構，如律師、會計師、審計事務所、設計院等。
(3)基於案例:基於案例的辦公信息系統，如法院、公安、醫院等使用的系統。
(4)面向生產:生產管理主要涉及生產計劃、組織、指揮和控制，輔以業務管理，或面向生產的辦公信息系統；
(5)運營型:以經營管理為主，主要涉及市場需求、供銷流通、預測決策、客戶服務等。如銀行、公司、商店等使用的辦公信息系統。
(6)政府型:如各級政府的辦公系統、信息中心等。