1，資金來源不同。
根據不同類型的機構，國家財政是全部或部分或根本沒有；理論上，企業編制與國家財政如何無關。
2.待遇和地位不同。
這在很多地方都有體現。壹般來說，在體制內的行政或事業單位中，行政編制的地位最高，待遇最好。這裏說的待遇包括工資、福利、晉升機會。兩者的稀缺性也在依次遞減，事業編制很多。這種編制占用了大量資源。所以國家嚴格限制其數量。但是事情需要這麽多人去做。
3.不同的職能和責任。
事業單位是全稱公益事業單位，有的事業單位也提供公共服務，有的其實是企業行政。由此看來，建立這項業務也是這些職能；企業編制是體制外的。