1、辦理清稅證明前，先打開電子稅務局，把當期的增值稅、附加稅、個稅、以及各類年報，統統都申報完畢。註銷前手裏還有未開完的發票，填寫發票繳銷表，把所有的空白發票全部繳銷。
2、購買了稅控機開具發票的企業，填寫發票稅控機繳銷表，把開票系統繳銷。企業有進出口權的，填寫出口退免稅備案撤回申報表，填好後，還需要拷備電子數據，前往稅局撤回出口退免稅備案。
3、企業註銷前，都需要清算企業的資產，同時辦理清稅證明，稅局也會核查企業的清算情況，還需要制作壹份清算報告書，列明企業的資產清算情況。
4、以上5步都辦理完結後，填寫註銷稅務登記申請審批表，主要填寫公司的基本信息、註銷原因、附送的資料，蓋上公司的公章。
5、稅局收到申報表後，會核查公司的正常流程是否辦理完結，同時會核查公司是否清繳了稅款，會核查公司的賬本，核查沒有問題後，就會出具壹份蓋有稅局印章的《清稅證明》給申請的公司。