1、保密電腦主要用於處理涉密信息和保護國家安全，通常用於軍事、政府、金融等領域，具有較高的安全性要求和保密級別。而普通電腦是普通人或企業用於日常工作、娛樂和學習的電腦，用途廣泛，包括文檔處理、網上瀏覽、娛樂遊戲等。
2、保密電腦具有更高的安全性要求，通常采用定制化的硬件和軟件，有嚴格的訪問控制和加密措施，以防止未經授權的訪問和信息泄露。而普通電腦的安全性要求相對較低，采用商用的硬件和軟件，安全性較保密電腦較低。