1、華仁藥業是亳州藥都的壹個企業，成立於1994年，主要生產和銷售中藥飲片、中藥材中藥材保健品等。公司目前已經成為安徽省最大的中藥材飲片生產商之壹，同時也是中國最大的中藥材飲片出口企業之壹。
2、安徽天源制藥有限公司也是亳州藥都的企業之壹，成立於1996年，主要從事中藥制劑的生產和銷售。公司生產的產品包括中藥提取物、中藥飲片等，其中最為著名的產品是“天源牌參茸保健品”。
3、安徽中恒制藥股份有限公司成立於2000年，是亳州藥都的壹家制藥企業，主要從事中藥粉劑、膠囊劑和顆粒劑等產品的研發和生產。公司目前擁有壹系列自主知識產權的藥品，其中最為著名的產品是“中恒牌感冒靈顆粒”。