（2）研究所生產飼料的行為合法，因為此行為屬於合理使用的範圍，法律規定，專為科學研究和實驗而使用有關專利的，不視為侵犯專利權的情形。
（3）該轉基因小鼠不能申請專利，法律規定動植物品種不能申請專利權。
（4）能，符合發明專利權的授予條件，新穎性，創造性，實用性，且不違反法律強制性規定
二、（1）不構成，因為構成使用在先，是在專利申請日前已經制造相同產品、使用相同方法或者已經作好制造、使用的必要準備，並且僅在原有範圍內繼續制造、使用的。顯然B廠不是。
（2）是，A廠享有獨占使用權、實施許可權、轉讓權和標示權，並承擔公開和繳納年費的義務。
（3）是，侵犯了A廠的獨占實施權，包括，制造權，使用權，銷售權。 承擔賠償責任。