建院以來，研究院始終堅持追求卓越和定位高端的理念，要將蘇州研究院辦成國際知名的研究院。辦院宗旨是打造三個壹流：
組建壹流的科研隊伍。依靠中國科大的品牌優勢和學科優勢，蘇州市的政策優勢、經濟優勢和區位優勢，吸引海內外優秀人才；
打造壹流的研究基地。開展高水平研究、創造具有自主知識產權的核心技術，為提高蘇州市的自主創新能力服務；
培養壹流人才。依靠壹流的科研隊伍和壹流的研究基地，為提高蘇州城市綜合競爭力輸送高質量的各類人才。
作為第壹個入駐獨墅湖高教區的研究院，中科大蘇州研究院為高教園區的迅速崛起和初具規模起到了引領和示範作用。